| 党群机构 | 行政机构 |
| 党委办公室（保密委员会办公室） | 校长办公室（法律事务办公室、云龙校区管理办公室） |
| 党委组织部（党校） | 发展规划处（学术委员会办公室、综合改革办公室） |
| 党委宣传部（新闻中心） | 人事处（党委教师工作部、人才工作办公室、人才交流中心） |
| 党委统战部 | 教务处（教学资源保障中心、招生办公室、语言文字工作委员会办公室、本科教学质量与监控办公室、教师教学发展中心、工程实训中心、创新创业学院、卓越人才培养强化部） |
| 纪委（监察专员办）（纪委办公室、监督检查处、审查调查处） | 科学技术研究院（军工保密办公室、协同创新办公室） |
| 巡察工作办公室 | 社会科学研究院 |
| 工会委员会（ 妇女联合会 ） | 交叉应用研究院（技术转移中心） |
| 团委（艺术教育中心） | 研究生院（党委研究生工作部、学位评定委员会办公室） |
| 机关党委 | 学科建设办公室 |
直属业务单位党委
| 学生工作处 （党委学生工作部、党委人民武装部、就业创业指导服务中心） |
| 产业党总支 | 国际合作交流处（港澳台事务办公室） |
| | 审计处 |
| 计划财务处 |
| 国有资产管理处（招投标办公室） |
| 实验室与设备管理处（分析测试中心） |
| 后勤管理处（卫生健康委员会办公室） |
| 基建处 |
| 保卫处（党委保卫部） |
| 离退休工作管理处（党委离退休工作部、关心下一代工作委员会办公室） |
| 发展委员会（共建办公室、教育发展基金会<校友联谊会>办公室、社会合作与服务办公室） |
| 信息化建设与管理处（信息网络中心） |
| 贾汪校区管理委员会 |
| 连云港校区管理委员会 |
